Protéomique

La protéomique basée sur la spectrométrie de masse (MS) est devenue un outil essentiel pour les biologistes au cours de la dernière décennie. La capacité d'un spectromètre de masse à identifier des milliers de protéines à partir d'un échantillon biologique complexe a révolutionné les expériences scientifiques. Toutefois, pour bien comprendre la fonction du protéome dans la santé et la maladie, il faut être capable de quantifier avec précision les protéines dans de nombreux types différents d’échantillons biologiques. L’invention de spectromètres de masse plus rapides et à plus haute résolution a permis la quantification de la dynamique complexe du protéome. Des isotopes stables lourds sont couramment utilisés pour générer des données protéomiques quantitatives précises et exactes. Les peptides marqués avec des isotopes stables lourds partagent des caractéristiques biochimiques identiques aux peptides « légers » ou non marqués, à l’exception d’une différence de masse. Le mélange de peptides lourds avec des peptides légers donne lieu à des paires de peptides qui co-éluent dans le spectromètre de masse, qui peut facilement distinguer les peptides en fonction de la différence de masse. La quantification des différences entre les protéomes soumis à différentes conditions biologiques ou expériences peut être obtenue en utilisant les peptides lourds comme étalon interne ou contrôle.

CIL propose une variété de matériaux marqués par des isotopes stables pour le marquage ou le marquage d'un protéome pour des analyses qualitatives/quantitatives basées sur MS. Ceux-ci peuvent être utilisés dans des applications telles que le dépistage de biomarqueurs et l’analyse de modèles de maladie pour aider à définir la biologie des systèmes, à améliorer le traitement et à mieux comprendre la maladie. Chaque section ci-dessous décrit une application spécifique ainsi que les matériaux marqués (et non marqués) par des isotopes stables qui peuvent être utilisés.

Étiquetage des produits chimiques

Pour faciliter la synthèse de peptides marqués par des isotopes stables, CIL propose une gamme d'acides aminés protégés et de résines préchargées.

Marquage chimique

CIL propose une collection de réactifs de méthylation réductrice et un kit de marquage des glycanes appelé INLIGHT^® (Individuality Normalization when Labelling with Isotopic Glycan Hydrazide Tag) pour la quantification relative.

Étiquetage enzymatique

L'incorporation de deux atomes ¹⁸O dans chaque extrémité C-terminale de peptides dérivés de la digestion protéolytique d'échantillons biologiques est devenue l'une des principales stratégies de marquage mondiales utilisées en protéomique quantitative comparative.