Proteómica

La proteómica basada en espectrometría de masas MS se ha convertido en una herramienta esencial para los biólogos durante la última década. La capacidad de un espectrómetro de masas para identificar miles de proteínas a partir de una muestra biológica compleja ha revolucionado los experimentos científicos. Sin embargo, para comprender completamente la función del proteoma en la salud y la enfermedad, es necesario tener la capacidad de cuantificar con precisión las proteínas en muchos tipos diferentes de muestras biológicas. La invención de espectrómetros de masas más rápidos y de mayor resolución ha permitido la cuantificación de la dinámica compleja del proteoma. Los isótopos estables pesados ​​se emplean de forma rutinaria para generar datos proteómicos cuantitativos precisos y exactos. Los péptidos marcados con isótopos estables pesados ​​comparten características bioquímicas idénticas a los péptidos "ligeros" o no marcados, excepto por una diferencia en masa. La mezcla de péptidos pesados ​​con péptidos ligeros da como resultado pares de péptidos que coeluyen en el espectrómetro de masas, que puede distinguir fácilmente entre los péptidos según la diferencia de masa. La cuantificación de las diferencias entre proteomas sometidos a diferentes condiciones biológicas o experimentos se puede lograr cuando se utilizan los péptidos pesados ​​como estándar interno o control.

CIL ofrece una variedad de materiales marcados con isótopos estables para marcar o etiquetar un proteoma para análisis cualitativos/cuantitativos basados ​​en MS. Estos se pueden emplear en aplicaciones como la detección de biomarcadores y el análisis de modelos de enfermedades para ayudar a definir la biología de sistemas, mejorar el tratamiento y comprender mejor las enfermedades. Cada sección a continuación describe una aplicación específica junto con los materiales marcados (y no etiquetados) con isótopos estables disponibles en ella para su uso.

Etiquetado de productos químicos

Para ayudar en la síntesis de péptidos marcados con isótopos estables, CIL ofrece una variedad de aminoácidos protegidos y resinas precargadas.

Etiquetado químico

CIL ofrece una colección de reactivos de metilación reductores y un kit de etiquetado de glicanos denominado INLIGHT^® (Normalización de la individualidad al etiquetar con etiqueta isotópica de glicano hidrazida) para la cuantificación relativa.

Etiquetado enzimático

La incorporación de dos átomos de ¹⁸O en cada extremo C de péptidos derivados de la digestión proteolítica de muestras biológicas se ha convertido en una de las principales estrategias de etiquetado globales utilizadas en proteómica cuantitativa comparativa.