Proteomik

Die auf Massenspektrometrie (MS) basierende Proteomik ist im letzten Jahrzehnt zu einem unverzichtbaren Werkzeug für Biologen geworden. Die Fähigkeit eines Massenspektrometers, Tausende von Proteinen aus einer komplexen biologischen Probe zu identifizieren, hat wissenschaftliche Experimente revolutioniert. Um die Funktion des Proteoms bei Gesundheit und Krankheit vollständig zu verstehen, muss man jedoch in der Lage sein, Proteine ​​in vielen verschiedenen Arten biologischer Proben genau zu quantifizieren. Die Erfindung schnellerer und höher auflösender Massenspektrometer hat die Quantifizierung komplexer Proteomdynamiken ermöglicht. Schwere stabile Isotope werden routinemäßig eingesetzt, um präzise und genaue quantitative proteomische Daten zu generieren. Mit schweren stabilen Isotopen markierte Peptide haben bis auf einen Unterschied in der Masse identische biochemische Eigenschaften wie „leichte“ oder unmarkierte Peptide. Das Mischen schwerer Peptide mit leichten Peptiden führt zu Peptidpaaren, die gemeinsam in das Massenspektrometer eluieren, das die Peptide anhand des Massenunterschieds leicht unterscheiden kann. Die Quantifizierung von Unterschieden zwischen Proteomen, die unterschiedlichen biologischen Bedingungen oder Experimenten ausgesetzt sind, kann erreicht werden, wenn die schweren Peptide als interner Standard oder als Kontrolle verwendet werden.

CIL bietet eine Vielzahl stabil isotopenmarkierter Materialien zum Markieren oder Markieren eines Proteoms für qualitative/quantitative MS-basierte Analysen. Diese können in Anwendungen wie dem Biomarker-Screening und der Analyse von Krankheitsmodellen eingesetzt werden, um die Systembiologie zu definieren, die Behandlung zu verbessern und Krankheiten besser zu verstehen. Jeder Abschnitt unten beschreibt eine spezifische Anwendung zusammen mit den darin zur Verwendung verfügbaren, mit stabilen Isotopen markierten (und nicht markierten) Materialien.

Chemische Kennzeichnung

Um die Synthese stabil isotopenmarkierter Peptide zu unterstützen, bietet CIL eine Reihe geschützter Aminosäuren und vorbeladener Harze an.

Chemische Markierung

CIL bietet eine Sammlung reduktiver Methylierungsreagenzien und ein Glykan-Tagging-Kit namens INLIGHT^® (Individuality Normalization when Labeling with Isotopic Glycan Hydrazide Tag) für die relative Quantifizierung an.

Enzymatische Markierung

Der Einbau von zwei ¹⁸O-Atomen in jeden C-Terminus von Peptiden, die aus der proteolytischen Verdauung biologischer Proben stammen, hat sich als eine der führenden globalen Markierungsstrategien für die vergleichende quantitative Proteomik herausgestellt.