Proteinexpression und Standards

Quantitative proteomische Studien (mittels MS- oder NMR-Analyse) können von der Verwendung gereinigter, markierter intakter Proteine ​​als interne Standards erheblich profitieren. Die Verwendung ordnungsgemäß gefalteter, markierter intakter Proteine ​​sind ideale interne Standards, da sie die physikalischen und chemischen Eigenschaften des endogenen Zielproteins in einer Probe vor, während und nach der Verdauung so genau wie möglich nachahmen. Insbesondere erfahren sie einen ähnlichen Grad an proteolytischer Spaltung wie das unmarkierte Gegenstück, wodurch die Genauigkeit der experimentellen Ergebnisse der Isotopenverdünnungsmassenspektrometrie (IDMS) sowohl für Middle-Down- als auch für Bottom-Up-Methoden verbessert wird.

Zusätzlich zu einigen katalogstabilen isotopenmarkierten Proteinen freut sich CIL, markierte Zellwachstumsmedien für E. coli, Insekten-, Hefe- und eukaryontische Zellen. Spezifische menschliche Proteine ​​können in einer Vielzahl von Zelltypen unter Verwendung dieser Medien in Verbindung mit rekombinanten Techniken überexprimiert werden, so dass man eine relativ große Menge markierten gereinigten Proteins für proteomische Studien erhalten kann. Ebenfalls erhältlich sind Reagenzien und Kits von CellFree Sciences (CFS), die zur Herstellung einheitlicher oder selektiv markierter Proteine ​​in Ausbeuten verwendet werden, die ideal für MS-basierte Proteomanwendungen sind.

Stabilisotopenmarkierte Peptide und Proteinreagenzien/Kits

Verwandte Ressourcen

Verwandte Produkte

❛❛Wir verwenden CIL, weil sie zusätzlich zu ihren markierten Medien ein umfangreiches Sortiment an Reagenzien für die biomolekulare NMR enthalten, wie Puffer, Detergenzien und Reduktionsmittel. Sie waren auch sehr hilfreich, indem sie neue Produkte als Reaktion auf Kundenbedürfnisse hinzufügten.❜❜

– Christopher Lepre, PhD
Wissenschaftlicher Mitarbeiter II, Strukturbiologie

❛❛Wir sind mit der Qualität der BioExpress® 6000-Medien von CIL sehr zufrieden. Die Wachstumsmedien für Säugetierzellen von CIL bieten eine hervorragende Möglichkeit, isotopenmarkierte Proben eukaryotischer Proteine für NMR-Studien zu erhalten. Beim Vergleich der BioExpress 6000-Medien von CIL mit typischen reichhaltigen Wachstumsmedien wurden keine Unterschiede in den Wachstums- oder Expressionsraten festgestellt.❜❜

– Professor Dr . Harald Schwalbe
Institut für Organische Chemie

❛❛In unseren Händen funktionierte CILs BioExpress® 1000 wie ein Zauber. Die Zellwachstumsrate und das Proteinexpressionsniveau stimmten im Wesentlichen mit den Ergebnissen überein, die mit Luria-Brühe erzielt wurden, und die 15N-Markierungseffizienz war ausgezeichnet.❜❜

– Tero Pihlajamaa, PhD
Finnisches Biologisches NMR-Zentrum, Institut für Biotechnologie

Häufig gestellte Fragen

Was ist ein quantitativer Proteomik-Workflow von unten nach oben? Bottom-up-Proteomik ist ein gängiger MS-basierter Arbeitsablauf, der zur Identifizierung und/oder Quantifizierung von Proteinen in einer bestimmten Probe verwendet wird, indem einzigartige Peptide analysiert werden, die durch die enzymatische Spaltung ihrer Proteine ​​erzeugt werden.

Ist CIL in der Lage, andere Proteine ​​zu exprimieren? Die Primär- und Sekundärstrukturen müssen evaluiert werden. Bitte wenden Sie sich an Nexomics Biosciences (info@nexomics.com) mit vollständigen Anfragedetails (z. B. UniProt-ID, Etikettierungstyp, Charakterisierungsanforderungen, Menge). Bitte beachten Sie auch Nexomics Biosciences Weitere Informationen zu ihren Proteinproduktionsdiensten finden Sie auf der Website.

Beispielreferenzen

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Minikel, E.V.; Kuhn, E.; Cocco, A.R.; et al. 2019. Domain-specific quantification of prion protein in cerebrospinal fluid by targeted mass spectrometry. Mol Cell Proteomics, 18(12), 2388-2400. PMID: 31558565
Lacabanne, D.; Fogeron, M.L.; Wiegand, T.; et al. 2019. Protein sample preparation for solid-state NMR investigations. Prog Nucl Magn Reson Spectrosc, 110, 20-33. PMID: 30803692
Zhong, F.; Xu, M.; Metz, P.; et al. 2018. A quantitative metabolomics study of bacterial metabolites in different domains. Anal Chim Acta, 1037, 237-244. PMID: 30292298
Reddy, P.T.; Brinson, R.G.; Hoopes, J.T.; et al. 2018. Platform development for expression and purification of stable isotope labeled monoclonal antibodies in Esherichia coli. MAbs, 10(7), 992-1002. PMID: 30060704
Zhang, C.; Gao, S.; Molascon, A.J.; et al. 2014. Quantitative proteomics reveals histone modifications in crosstalk with H3 lysine 27 methylation. Mol Cell Proteomics, 13(3), 749-759. PMID: 24382802
Hessling, B.; Buttner, K.; Hecker, M. 2013. Global relative quantification with liquid chromatography-matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (LC-Maldi-TOF) – cross-validation with LTQ-Orbitrap proves reliability and reveals complementary ionization preferences. Mol Cell Proteomic, 12(10), 2911-2920. PMID: 23788530
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Singh, S.; Springer, M.; Steen, J.; et al. 2009. FLEXIQuant: a novel tool for the absolute quantification of proteins, and the simultaneous identification and quantification of potentially modified peptides. J Proteome Res, 8(5), 2201-2210. PMID: 19344176