Isotopics – December 2018 | Edition 8

A medida que continuamos empujando los límites del análisis biológico a través de múltiples campos ómicos, reconocemos que las herramientas para el éxito son más importantes y más diversas que nunca. CIL sigue dedicado a la investigación multiómica mediante el desarrollo de nuevos productos de isótopos estables para comprender mejor los mecanismos de la enfermedad y detectar biomarcadores con más confianza y precisión que nunca. Nuestra oferta de productos consiste en estándares individuales altamente enriquecidos, así como mezclas y kits complejos de múltiples componentes para calificación, cuantificación y control de calidad. Los artículos seleccionados para esta edición utilizan una miríada de estos productos; por favor, eche un vistazo por sí mismo.

La propionilación de lisina aumenta la cobertura de la secuencia de proteoma y permite una estrategia de etiquetado "SILENT SILAC" para la cuantificación relativa de proteínas

Schräder, C.U.; Moore, S.; Goodarzi, A.A.; et al.

Los protocolos proteómicos cuantitativos que incorporan isótopos estables tienden a hacerlo con procesos metabólicos o químicos y, por lo general, utilizan tripsina. Aunque se ha demostrado la utilidad de las proteasas alternativas, los estudios cuantitativos utilizan estas alternativas son efectivamente inexistentes. Aquí, Schriemer y sus colegas desarrollaron una nueva estrategia de etiquetado de isótopos para cuantificar las proteínas metabólicamente marcadas en el nivel de MS2 independientemente de la proteasa. Esto se basa en el etiquetado metabólico similar a SILAC y el cuantitativo similar a TMT. análisis, para ofrecer una mejor cobertura de secuencias de proteínas sin sacrificar las identificaciones de proteínas.

Levadura marcada con ¹³C como estándar interno para la cuantificación de aminoácidos basada en MS de alta resolución LC-MS / MS y LC en plasma humano

Hermann, G.; Schwaiger, M.; Volejnik, P.; et al.

Los extractos etiquetados isotópicamente pueden ser estándares poderosos para la cuantificación de analitos en ensayos basados en EM. Aquí, Hermann y sus colegas evaluaron la utilidad de un extracto de levadura de metabolito producido in vivo en la cuantificación absoluta de 14 aminoácidos en plasma humano (SRM 1950). El contenido de aminoácidos del extracto de levadura U-¹³C (ISO1) se determinó utilizando SRM 2389a. La ISO1 calibrada sirvió como estándares internos en las validaciones multiplataforma y se encontró que ofrecía una excelente precisión sin impacto en otras cifras de mérito de ensayo.

El 2-hidroxiglutarato derivado de la glutamina se asocia con la progresión de la enfermedad en las neoplasias malignas de células plasmáticas

Gonsalves, W.I.; Ramakrishnan, V.; Hitosugi, T.; et al.

Para comprender mejor la importancia clínica del 2-hidroxiglutarato (2-HG) en su progresión de las neoplasias malignas de células plasmáticas, Gonsalves y sus colegas investigaron la producción y el flujo de metabolitos del ciclo del TCA en varios análisis celulares y tisulares. Las evaluaciones cuantitativas fueron facilitadas por un enfoque de metabolómica estable resuelta por isótopos (SIRM) que utilizó estándares U-¹³C y metodologías basadas en EM. Este estudio reveló que el 2-HG se produce a partir de células plasmáticas clonales (PC) y es detectable en la sangre periférica y el plasma de la médula ósea de pacientes con trastornos de PC. También se observó evidencia de la producción exclusiva de 2-HG a partir del metabolismo de la glutamina que parece estar correlacionada con la regulación ascendente de c-Myc. Este es un hallazgo clínicamente significativo teniendo en cuenta el vínculo funcional del 2-HG con el mieloma múltiple que tiene el potencial de ser explotado como un factor de decisión en el inicio de la terapia.

La insuficiencia cetogénica hepática reprograma el metabolismo del glucógeno hepático y el lipidoma

d'Avignon, D.A.; Puchalska, P.; Ercal, B.; et al.

En este artículo, los autores utilizan metabolómica y trazadores de isótopos estables en animales para revelar una relación inesperada entre la insuficiencia cetogénica y el metabolismo del glucógeno hepático. Encuentran que cuando la cetogénesis se ve afectada en ratones al derribar la 3-hidroximetilglutaril-CoA sintasa, la producción hepática de glucosa aumentó en más del 60% en el estado alimentado. Este aumento en la producción de glucosa fue impulsado por la descomposición del glucógeno. Además, los autores muestran que los bis(monoacilglicero)fosfatos se acumulan en los hígados de animales alimentados con insuficiencia cetogénica. Estos lípidos, que también se acumularon en modelos de ratón de enfermedad del hígado graso no alcohólico (EHGNA), pueden representar un biomarcador generalizado para la progresión de la EHGNA.

Un enfoque metabolómico dirigido para el diagnóstico clínico de errores congénitos del metabolismo

Jacob, M.; Malkawi, A.; Albast, N., et al.

En un esfuerzo por mejorar la interpretación biológica en la investigación clínica, Rahman y sus colegas del Hospital de Especialistas y Centro de Investigación King Faisal desarrollaron un método metabolómico LC-MS / MS dirigido para detectar una amplia colección de errores congénitos del metabolismo (IEM) en tejidos de ratas y humanos. El ensayo validado utiliza estándares de isótopos estables y se demostró que es sensible y robusto en el perfil metabólico diferencial de IEM comunes.

Una guía para el análisis de flujo metabólico ¹³C para el biólogo del cáncer

Antoniewicz, M.R.

Aquí Maciek Antoniewicz revisa el análisis de flujo metabólico (MFA) de ¹³C para cuantificar los flujos intracelulares en el metabolismo de las células cancerosas. Se detallan los fundamentos para el diseño experimental, la medición analítica y el análisis estadístico, junto con los méritos y limitaciones de varios enfoques de trazadores.

La imagen del año de SNMMI es el endocitos 177 Lu PSMA-617

Cada año, SNMMI elige una imagen que ejemplifica los avances más prometedores en el campo de la medicina nuclear y la imagen molecular. Las tomografías por emisión de positrones (PET) que muestran resultados muy positivos obtenidos en pacientes con cáncer después del tratamiento con la terapia de cáncer de próstata con lutecio radionúclido-177 (¹⁷⁷Lu) PSMA-617 fueron seleccionadas por la Sociedad de Medicina Nuclear e Imagen Molecular (SNMMI) como la Imagen SNMMI del año. ABX (una subsidiaria de CIL) licenció esta terapia el año pasado a Endocyte.