Etiquetado de tipo metilo y aminoácidos
Los grupos metilo carbono-13 protonados en proteínas deuteradas son excelentes sondas para la estructura y la dinámica, y son cruciales cuando se estudian complejos proteicos y proteicos de alto peso molecular. El etiquetado con metilo se refiere a métodos que introducen grupos 13CH3 o 13CHD2 en una proteína deuterada uniforme. El marcado de metilo se puede lograr tanto en sistemas de expresión procariotas como eucariotas agregando los aminoácidos en cantidades suficientes directamente al medio de cultivo celular antes de la inducción de proteínas. Para los cultivos de E. coli, se puede lograr la protonación selectiva en grupos metilo de isoleucina, leucina y valina (ILV) agregando precursores de α-cetoácido al medio de cultivo celular basado en D2O 1 hora antes de la inducción. α-cetoisobutirato se convierte en isoleucina, y el ácido α-cetoisovalérico se convierte en leucina y valina. Esta metodología ha aumentado drásticamente el rango de peso molecular útil de proteínas y complejos proteicos evaluables por RMN cuando se utilizan técnicas de metil TROSEY.
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Ejemplos de referencias
Kano, H.; Toyama, Y.; Imai, S.; et al. 2019. Structural mechanism underlying G protein family-specific regulation of G protein-gated inwardly rectifying potassium channel. Nat Commun, 10(1), 2008. PMID: 31043612
Kurauskas, V.; Schanda, P.; Sounier, R. 2017. Methyl-specific isotope labeling strategies for NMR studies of membrane proteins. Methods Mol Biol, 1635, 109-123. PMID: 28755366