Isotopics – December 2018 | Edition 8

随着我们继续在多个组学领域推动生物分析的界限,我们认识到成功的工具比以往任何时候都更加重要和多样化。CIL仍然致力于多组学研究,开发新的稳定同位素产品,以更好地了解疾病机制并以前所未有的信心和准确性检测生物标志物。我们的产品包括非常丰富的单个标准以及复杂的多组分混合物和用于认证,定量和质量控制的试剂盒。本版中选择的文章使用了无数这些产品;请您亲自体验。

赖氨酸丙酰化可提高蛋白质组序列覆盖率,并实现用于相对蛋白质定量的“沉默 SILAC”标记策略

Schräder, C.U.; Moore, S.; Goodarzi, A.A.; et al.

结合稳定同位素的定量蛋白质组学方案倾向于通过代谢或化学过程这样做,并且通常利用胰蛋白酶。虽然替代蛋白酶的效用已被证明,但使用这些替代药物的定量研究 实际上不存在。在这里,Schriemer及其同事开发了一种新的同位素标记策略,可以在MS2水平上量化代谢标记的蛋白质,而不管蛋白酶如何。这依赖于类似SILAC的代谢标记和类似TMT的定量 分析,在不牺牲蛋白质鉴定的情况下提供更高的蛋白质序列覆盖率。

13C-标记酵母作为人血浆中 LC-MS/MS 和 LC 高分辨率基于 MS 的氨基酸定量的内标

Hermann, G.; Schwaiger, M.; Volejnik, P.; et al.

同位素标记的提取物可以成为基于MS的测定中分析物定量的强大标准。在这里,Hermann及其同事评估了体内生产的代谢物酵母提取物在人体血浆中14个氨基酸的绝对定量中的效用(SRM 1950)。使用SRM 2389a测定U-13C酵母提取物(ISO1)的氨基酸含量。经过校准的ISO1作为跨平台验证的内部标准,并被发现可提供出色的准确性,而不会影响其他分析品质因数。

谷氨酰胺衍生的2-羟基戊二酸与浆细胞恶性肿瘤的疾病进展有关

Gonsalves, W.I.; Ramakrishnan, V.; Hitosugi, T.; et al.

为了更好地了解2-羟基戊二酸(2-HG)在浆细胞恶性肿瘤进展中的临床意义,Gonsalves及其同事研究了各种细胞和组织分析中TCA循环代谢物的产生和通量。利用U-13C标准和基于MS的方法的稳定同位素分辨代谢组学(SIRM)方法促进了定量评估。这项研究表明,2-HG是由克隆浆细胞(PC)产生的,可以在PC疾病的患者的外周血和骨髓血浆中检测到。还观察到有证据表明谷氨酰胺代谢独家产生2-HG,这似乎与c-Myc上调有关。考虑到 2-HG 与多发性骨髓瘤的功能联系,这是一项具有临床意义的发现,该功能链接有可能被利用为治疗开始的决定因素。

肝生酮功能不全 再编程 肝糖原代谢和脂质组

d'Avignon, D.A.; Puchalska, P.; Ercal, B.; et al. 

在本文中,作者使用动物中的代谢组学和稳定同位素示踪剂来揭示生酮功能不全与肝糖原代谢之间的意外关系。他们发现,当通过敲低3-羟甲基戊二酰辅酶A合酶在小鼠中生酮作用受损时,在喂食状态下肝葡萄糖产生增加60%以上。葡萄糖产量的增加是由分解糖原推动的。此外,作者表明,双(单酰基甘油)磷酸盐积聚在生酮功能不全的喂养动物的肝脏中。这些脂质也积聚在非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的小鼠模型中,可能代表NAFLD进展的广义生物标志物。

一种靶向代谢组学方法在临床诊断先天性代谢缺陷中的应用

Jacob, M.; Malkawi, A.; Albast, N., et al.

为了改善临床研究中的生物学解释,来自费萨尔国王专科医院和研究中心的Rahman及其同事开发了一种有针对性的LC-MS / MS代谢组学方法,以筛选大鼠和人体组织中广泛的先天性代谢错误(IEM)。经过验证的测定利用稳定同位素标准品,并被证明在常见IEM的鉴别代谢分析中具有敏感性和稳健性。

癌症生物学家13C代谢通量分析指南

Antoniewicz, M.R.

Here Maciek Antoniewicz reviews 13C 代谢通量分析(MFA),用于量化癌细胞代谢中的细胞内通量。详细介绍了实验设计,分析测量和统计分析的基本原理,以及各种示踪剂方法的优点和局限性。

SNMMI年度图像是末端细胞177 Lu PSMA-617

每年,SNMMI都会选择一幅图像,以体现核医学和分子成像领域最有希望的进步。正电子发射断层扫描(PET)显示,用放射性核素镥-177(177Lu)PSMA-617前列腺癌治疗后,癌症患者获得非常积极的结果,被核医学和分子成像学会(SNMMI)选为年度SNMMI图像。ABX(CIL子公司)去年将这种疗法授权给Endocyte。